En materia de recursos para su financiamiento, el Plan de Conectividad Austral junto con proponer una nueva manera de planificar y ejecutar una cartera de proyectos en un territorio particular, incorpora las capacidades presupuestarias de los Ministerios de Obras Públicas, de Transportes y Telecomunicaciones, y de los Gobiernos Regionales, en instrumentos tales como los convenios de programación y subsidios a la oferta y demanda, que permiten planificar adecuadamente las inversiones a lo largo del tiempo dando sustentabilidad económica a las propuestas de infraestructura contempladas en el Plan. Estos recursos están dirigidos a financiar:

-          Obras de infraestructura

-          Mejoras en la calidad de Servicio (frecuencias, tiempos de viaje, seguridad, etc.)

-          Subsidios a la oferta y la demanda

El MOP contempla obras y servicios de Vialidad, Obras Portuarias y Aeropuertos, comprende 28 proyectos integrales con una inversión sectorial MOP y aportes FNDR al 2014 de más de 343 mil millones de pesos, dentro de los cuáles se consideran 4 contratos concesionados (3 de transporte marítimo,  1 portuario), 6 contratos plurianuales de servicios de transporte marítimo, lacustres y fluviales, con su infraestructura portuaria y de servicios asociados; 7 proyectos de Construcción de infraestructura Aeroportuaria; 10 proyectos de mejoramiento de aeródromos; 4 programas de conservación de pequeños aeródromos; 3 Corredores viales longitudinales estructurantes (Rutas 7, 9 y Longitudinal Tierra del Fuego-Navarino); 8 Corredores viales transversales; 4 Conexiones viales fronterizas; 2 proyectos de red que consideran construcción y mejoramiento de caminos, entre otros.